רשם האגודות השיתופיות מתמנה על ידי שר התעשייה, המסחר והתעסוקה בצו כללי ומיוחד לפיו מוענקות לו הסמכויות על פי הפקודה, התקנות והצווים. תפקידיו וסמכויותיו של הרשם רחבים למדי וזאת בשל האופי המיוחד של התנועה הקואופרטיבית, שהיא תנועה כלכלית - חברתית, בעלת מעמד במשק הלאומי בעיקרבהתיישבות, בקליטת העלייה ובביצור גבולות המדינה ובביטחונה.